Οι συνεχόμενες προσφυγές στο Συμβούλιο της Επικρατείας κατά των περιβαλλοντικών όρων του έργου, όπως και η απόφαση να μην κατεδαφιστούν τα τρία διατηρητέα κτίρια της οδού Αβέρωφ και το παλαιό τελωνείο όπως επίσης και το κτίριο των προσκόπων στο Πεδίον του Άρεως σε συνδυασμό με πλήθος οικονομικών προβλημάτων που ανέκυψαν από την χρηματοδότηση του έργου από τις τράπεζες, θέτουν εν αμφιβόλω την υλοποίηση του.
Η ηγεσία του ΥΠΕΧΩΔΕ αναζητεί εναγωνίως λύση στα ανυπέρβλητα προβλήματα, καθώς η ματαίωση του έργου θα λειτουργήσει ως «βαρίδι» εν όψει των επερχόμενων βουλευτικών εκλογών.
Το έργο ξεκίνησε το 2002 και η αρχική εκτίμηση κόστους ανερχόταν στα 520 εκατομμύρια ευρώ. Οι πολλές όμως τεχνικές αλλαγές και οι ανάγκες νέων περιβαλλοντολογικών σχεδίων επιβάρυναν το έργο με 150 εκατομμύρια ευρώ.
Η κοινοπραξία «Θερμαϊκή Οδός» -αποτελείται από τις εταιρείες Ελλάκτωρ, Βoskalis και Αρχιρόδον- που έχει αναλάβει το έργο «τηρεί σιγή ιχθύος».